二氧化碳濃度控制
二氧化碳濃度可以通過(guò)紅外傳感器（IR）或熱導傳感器（TC）進(jìn)行測量。兩種傳感器各有優(yōu)缺點(diǎn)。
熱導傳感器監控CO2濃度的工作原理是基于對內腔空氣熱導率的連續測量，輸入CO2氣體的低熱導率會(huì )使腔內空氣的熱導率發(fā)生變化，這樣就會(huì )產(chǎn)生一個(gè)與CO2濃度直接成正比的電信號。
TC控制系統的一個(gè)缺點(diǎn)就是箱內溫度和相對濕度的改變會(huì )影響傳感器的精確度。當箱門(mén)被頻繁打開(kāi)時(shí)，不僅CO2濃度，溫度和相對濕度也會(huì )發(fā)生很大的波動(dòng)，因而影響了TC傳感器的精度。當需要精確的培養條件和頻繁開(kāi)啟培養箱門(mén)時(shí)，此控制系統就顯得不太適用了。
紅外傳感器（IR）它是通過(guò)一個(gè)光學(xué)傳感器來(lái)檢測CO2水平的。IR系統包括一個(gè)紅外發(fā)射器和一個(gè)傳感器，當箱體內的CO2吸收了發(fā)射器發(fā)射的部分紅外線(xiàn)之后，傳感器就可以檢測出紅外線(xiàn)的減少量，而被吸收紅外線(xiàn)的量正好對應于箱體內CO2的水平，從而可以得出箱體內CO2的濃度。
相對濕度
箱內濕度對于培養工作來(lái)說(shuō)是一項非常重要然而又經(jīng)常被忽略的因素。維持足夠的濕度水平并且要有足夠快的濕度恢復速度（如在開(kāi)關(guān)門(mén)后）才能保證不會(huì )由于過(guò)度干燥而導致培養失敗。
目前大多數的二氧化碳培養箱是通過(guò)增濕盤(pán)的蒸發(fā)作用產(chǎn)生濕氣的（其產(chǎn)生的相對濕度水平可達95%左右，但開(kāi)門(mén)后濕度恢復速度很慢）。盡量選擇濕度蒸發(fā)面積大的培養箱，因為濕度蒸發(fā)面積越大，越容易達到最大相對飽和濕度并且開(kāi)關(guān)門(mén)后的濕度恢復的時(shí)間越短。
污染物的控制
二氧化碳培養箱的90℃濕熱滅菌循環(huán)通過(guò)了英國健康保護所（HPA）評估，證明這是一個(gè)使真菌、細菌孢子和營(yíng)養細胞失活的有效方法。
污染是導致細胞培養失敗的一個(gè)主要因素，二氧化碳培養箱的制造商們設計了多種不同的裝置去減少和防止污染的發(fā)生，其主要途徑都是盡量減少微生物可以生長(cháng)的區域和表面，并結合自動(dòng)排除污染裝置來(lái)有效防止污染的產(chǎn)生。
例如，鑒于CO2培養箱在使用過(guò)程中有時(shí)會(huì )伴有霉菌生長(cháng)，為確保培養箱免受污染且保證儀器箱體內的生物清潔性，有些公司開(kāi)發(fā)設計了帶有紫外消毒功能的CO2培養箱；還有公司設計ULPA高效濾器能過(guò)濾培養箱內空氣，可過(guò)濾除去99.97%的0.3um以上的顆粒；此外，90?C濕熱滅菌裝置可以殺死箱內所有污染微生物，甚至芽孢等耐高溫微生物，這些裝置對于細胞培養來(lái)說(shuō)是更有安全保障的。
使用注意事項
1.儀器應放置在平整的地面上，環(huán)境應清潔整齊，干燥通風(fēng)；
2.不可將流入氣體壓力調至過(guò)大，以免沖破管道；